为加速农作物新品种选育、推动种子产业化和现代化步伐，保障国家粮食安全，农业部根据我国农作物布局和发展的需要，于2000年12月启动了国家级农作物改良中心项目建设。由黑龙江省农科院克山分院承建的“国家马铃薯改良中心”项目分别于2003年和2006年分两期进行了投资建设。两期项目总投资1370万元。项目建设内容：建马铃薯储藏室、实验温室等土建工程6300平方米；完成试验田改造1000亩，修建网棚5000平方米；配置农机具等仪器设备123台（套）。

目前，随着中心的建成，加快了马铃薯基础理论和分子标记辅助育种技术利用及专用品种产业化的研究，并成为我国马铃薯科研和专用品种产业化示范基地。

国家马铃薯改良中心为全国主要马铃薯科研单位、生产单位提供包括资源材料、新品种、科枝交流、合作研究、人才培养等方面全方位服务。主要任务是开展马铃薯遗传资源、种质创新、育种理论和方法、组织合作、承担国家（省和地市）重大课题等项研究工作，有重点地加强细胞工程、基因工程，分子标记辅助育种技术等新途径和新方法在马铃薯种质改良中应用的研究；同时承担人才培养、提供新品种或新成果、科技信息交流等项工作，在较短时间内使我国马铃薯研究接近或达到国际先进水平。